El Sistema de Gestión de la Calidad se aplica al Control de calidad y vigilancia sanitaria de las aguas de consumo humano y lúdicas. Toma de muestras y análisis.

La implementación del sistema de gestión de calidad ayuda a mejorar el desempeño global del Laboratorio, de modo que ha de servir como un medio para cumplir la Política de Calidad, para alcanzar sus objetivos de calidad, para asegurar que sus servicios de toma de muestras, realización de ensayos físico químicos y microbiológicos para el control de calidad de las aguas son conforme con los requisitos especificados; para conseguir esto, el Laboratorio ha identificado los procesos necesarios para el sistema de gestión de la calidad y su aplicación a través de la empresa.

El Laboratorio está certificado según ISO 9001 desde el año 2004, en cumplimiento del Real Decreto 140/2003, de 7 de febrero, por el que se establecen los criterios sanitarios de la calidad del agua de consumo humano, que en su artículo 16, obliga a los laboratorios de control de la calidad del agua de consumo humano a la implantación de un sistema de aseguramiento de la calidad y validarlo ante una unidad externa de control de calidad, que realizará periódicamente una auditoria.